《心跳密语》讲述了一对年轻恋人之间的甜蜜与无奈。男主角在日常生活中无时无刻不在思念着女主角，尽管生活中的压力重重，但只要能和心爱的人在一起，所有的困难都变得微不足道。歌曲通过细腻的描写展现了两人短暂相聚时光的美好，同时也表达了男主角对未来的坚定信念，愿意为了爱情克服一切困难。
歌曲开头描述了男主角早晨起床后依然沉浸在昨晚与女友的电话中，手机还热得发烫，显示出他对女友的思念之深。刷牙时看到镜子里的自己傻笑，进一步强调了他内心的幸福。
“不怕 任凭生活在施压，就当是老天嫉妒我们俩”，这一句表现了男主角面对生活的压力时的乐观态度，他认为这些困难只是因为他们的爱情太过甜蜜，连上天都感到嫉妒。
“拥抱你的时光太短暂，数着你的心跳声计算，对你的思念我能说上好几天”，这几句歌词深情地表达了男主角对女友的眷恋之情，珍惜每一次相处的时光。
“最好的年纪最好的你，足够我克服所有难题”，这句话表明男主角认为有女友相伴就是人生中最美好的时刻，这样的爱情给了他无限的力量去面对生活的挑战。
“生活太难缠恨不得把我拆两半，一半留在你身边，一半去与生活对线”，这一段歌词生动地描绘了男主角内心的情感冲突，既想陪伴在女友身边，又不得不面对现实生活中的种种问题。